营养配餐师证书的发放主要由国家卫生健康委员会、人力资源和社会保障部、中国营养学会等相关政府部门和专业组织负责，这些部门和组织会根据国家相关政策和标准，对申请颁发营养配餐师证书的人员进行严格的审核和培训，确保证书的权威性和专业性。

国家卫生健康委员会是营养配餐师证书制度的主要制定和监管部门，根据《中华人民共和国食品安全法》和《中华人民共和国营养法》，卫生健康委员会负责制定食品安全和营养相关的法规、政策和标准，对营养配餐师的职业发展和行业管理进行指导，在营养配餐师证书的发放过程中，卫生健康委员会会对申请人的相关资格进行审核，确保其具备从事营养配餐工作的基本条件。

人力资源和社会保障部作为国家级职业技能鉴定机构，负责对营养配餐师的职业技能进行鉴定，在申请人通过卫生健康委员会的审核后，人力资源和社会保障部会组织专家对其进行职业技能培训和考核，确保申请人具备扎实的专业知识和实际操作能力，通过考核合格后，人力资源和社会保障部会颁发营养配餐师职业技能鉴定证书，作为申请人获得营养配餐师证书的必要条件。

中国营养学会作为一个专业的学术组织，也会参与到营养配餐师证书的发放工作中，中国营养学会负责组织和管理全国范围内的营养专业人才培训、学术交流和科研活动，对营养配餐师的专业发展提供支持和指导，在申请人完成人力资源和社会保障部的培训和考核后，中国营养学会会对申请人的学术水平和专业素养进行评估，最终决定是否颁发营养配餐师证书。

营养配餐师证书的发放涉及到多个政府部门和专业组织的共同参与，包括国家卫生健康委员会、人力资源和社会保障部、中国营养学会等，这些部门和组织会根据国家相关政策和标准，对申请人进行严格的审核和培训，确保证书的权威性和专业性，只有通过这一系列的审核和培训，申请人才能获得营养配餐师证书，从而在营养配餐行业中发挥专业作用。