财务管理师证书发证机关是指负责管理和颁发财务管理师职业资格证书的政府部门或机构，财务管理师证书的发证机关主要由国家人力资源和社会保障部、财政部、中国注册会计师协会等相关机构共同负责。
国家人力资源和社会保障部作为中国政府的主要职能部门之一，负责制定和实施国家职业资格证书制度，在财务管理领域，国家人力资源和社会保障部负责组织和管理全国性的财务管理师职业资格考试，对考试合格者颁发财务管理师职业资格证书，国家人力资源和社会保障部还负责对财务管理师职业资格证书的管理和监督，确保证书的合法性和权威性。
财政部作为中国的中央财政机关，负责制定和执行国家财政政策，对全国各级政府和企业的财务管理工作进行指导和监督，财政部在财务管理师职业资格证书的发放和管理方面也发挥着重要作用，财政部会根据国家人力资源和社会保障部的考试成绩和评价标准，对合格者进行资格审查，并发放财务管理师职业资格证书。
中国注册会计师协会作为中国唯一的全国性会计专业组织，负责管理和规范中国注册会计师(CPA)行业的发展，注册会计师是财务管理领域的重要人才，而财务管理师则是注册会计师的一个分支，中国注册会计师协会在财务管理师职业资格证书的发放和管理方面也具有一定的影响力，中国注册会计师协会会协助国家人力资源和社会保障部和财政部对财务管理师职业资格考试进行组织和管理，并对考试合格者进行资格审核和证书发放。
财务管理师证书发证机关是一个涉及多个政府部门和机构的复杂体系，在这个体系中，国家人力资源和社会保障部、财政部、中国注册会计师协会等机构共同承担着财务管理师职业资格证书的发放和管理任务，确保了证书的权威性和有效性，这也体现了中国政府对财务管理人才的重视和对职业资格证书制度的不断完善。
