阴茎根部皮肤反复瘙痒脱皮，最主要的原因包括两个方面，具体如下：第一、存在炎症，包括皮肤的细菌、真菌感染，以及毛囊的细菌、真菌感染。第二、过敏，由于某些过敏原的存在，导致病人表现出临床症状。无论哪一种情况，都建议到医院进行详细的检查，明确诊断，进行针对性的处理，比如炎症的病人，需要应用相应的抗生素来进行治疗，比如头孢菌素、喹诺酮类消炎药，罗红霉素、达克宁、酮康唑等等。若是过敏导致的，需要清除过敏原，然后选择抗过敏药物，如西替利嗪等等。