儿童结膜炎有自愈的倾向，但是恢复时间相对较长。

儿童多见的结膜炎类型一般为细菌性结膜炎，比如肺炎球菌、葡萄球菌感染结膜组织导致的炎症。发病比较急，初起会有眼睛的干涩感、痒感和异物感，然后会表现出眼睛结膜囊内分泌物增多，有时在晨起时可以将上下眼睑粘住。如果不用药物治疗，则病程在两周左右，儿童可以用妥布霉素滴眼液、左氧氟沙星滴眼液、红霉素眼膏等药物治疗，缩短病程。