十二指肠胃炎的病人的药物治疗首先要检测是否有幽门螺杆菌的感染，如果病人有幽门螺杆菌的感染，就得要四联疗法根除幽门螺杆菌。也就是一种质子泵抑制剂，比如奥美拉唑，雷贝拉唑等等和两种抗生素。比如阿莫西林克拉霉素呋喃唑酮，甲硝唑等等中的两种和一种铋剂。比如拘橼酸铋钾片四种疗法进行根除幽门螺杆菌，同时需要使用质子泵抑制剂抑制胃酸的分泌，以及使用一些铝碳酸镁硫糖铝等等保护胃黏膜。如果病人有腹胀，嗳气等等表现，也可以使用一些促进胃动力的药物，比如莫沙必利等等。