儿童碱性磷酸酶偏高的危害包括造成儿童缺钙，因为儿童患有维生素D缺乏性佝偻病的时候，不仅有体内血钙和血凝浓度的下降，同时会有碱性磷酸酶偏高的症状，此时儿童往往会有枕部出汗比较多、鸡胸、肋串珠等一系列的症状。还会造成儿童表现出肝病，碱性磷酸酶偏高往往也提示儿童患有胆汁淤积性肝病，此时孩子会有肝功能的异常，比如谷丙转氨酶、谷草转氨酶升高，儿童往往还会伴随黄疸。