大便时肛门疼痛，这种情况一般多见于肛周疾病，比如肛窦炎症、内痔、混合痔、肛裂、肛周脓肿都会造成肛门疼痛。可以来医院肛肠外科进行相关检查明确诊断，可以应用电子结肠镜检查或者是肛门镜检查明确诊断。治疗先可以应用马应龙麝香痔疮软膏进行涂抹肛门，也可以应用高锰酸钾溶液或者是中草药进行温水坐浴熏洗肛门。注意不要吃辣椒等食物，避免刺激肛门造成肛门不舒服。