角膜移植后眼睛红的原因有很多种，要具体的病情具体分析，不可一概而论。角膜移植术后短期内比如几天的时间，眼睛红是非常正常的，不一定是表现出了感染或者是表现出了排斥现象，有可能仅仅只是正常的术后反应。随着时间的延长眼红就逐渐的消失了。如果在角膜移植术后已经过了相当长的时间，比如几个月或者是几年，本来眼睛已经不红了，突然又表现出了眼睛发红的症状，这个时候一定要提高警惕，尽快的去医院眼科就诊，排除是否发生了角膜免疫排斥的可能，或者是原来的角膜疾病再次复发，又或者是表现出了新的病原体的感染，这些都是有可能的。针对不同的造成眼红的病因就要进行不同的治疗。如果确定是发生了术后的排斥，就要进行抗排斥的治疗，甚至是更换角膜的植片。若是发生了再次的感染，就要进行抗感染的治疗。