起床口臭的原因主要和卫生状况差、饮食、消化不良、便秘等表现有关。人体在晚上睡觉后由于口腔不能咀嚼，里面的氧气较少，容易繁殖厌氧菌，口腔清洁不到位，厌氧菌分解食物残渣时就会发生硫化物的味道，造成病人早上起床后表现出口臭。口腔内的细菌夜间繁殖比较多，还会分泌大量的分泌物，会随着人体的呼吸分泌到外面，因此早上的症状会更加明显。前一晚摄入了辛辣、刺激或味道较重的食物，如韭菜、大蒜、洋葱，这些食物会在胃肠道内产生较多气体，随着人体的呼吸排出，病人早上起床后也容易表现出口臭。部分人本身存在着消化不良，胃肠道蠕动的功能较慢，食物摄入后不能快速排空，产生气体较多，病人早上起床后口臭的症状明显。肠道菌群紊乱，有害菌增多会抑制大便的排出，造成大便在结肠内囤积，产生过多气体，这种情况也会造成病人早上起床后表现出口臭。除此以外，口腔方面的疾病，如龋齿、牙根的残留物、牙龈炎、牙周炎、糖尿病等因素，也会造成病人表现出口臭。