感染肛门疣后可选择中医、西医综合治疗。中医治疗以内外结合治疗为主，主要用清热除湿，脱敏止痒的中药口服，再加三甲、藏红花等中药熬夜泡洗。具体疗法可有以下两种：1、结扎疗法:对单个疣赘，其基底较小也可用结扎疗法，数日后疣赘可自行脱落，然后外用玉红膏，促使伤口愈合。2、推疣法:适用于明显高出皮面，疣赘小，数量少的病人。方法用棉花棒或刮匙和疣赘基底皮肤成30度角，向前推之，可将疣赘推除，然后压迫止血，包扎固定，每日换药，直至痊愈。西医治疗针对不同的疣体，采取不同的治疗方案。多采用手术疗法、冷冻疗法、激光疗法、电灼疗法等。在西医治疗的基础上综合中药汤剂口服、外用等，可取得事半功倍的效果。