胃肠神经官能症主要是以精神因素为主，而没有器质性的病理改变。因此在治疗方面以精神调理和行为方式改善为主。其次对于某些症状比较重者，可以给予对症治疗。比如如果睡眠不好，可以给予镇静剂、安定等；如果呕吐、腹胀明显，可以口服维生素B6或者是吗丁啉等；如果表现出腹痛很明显，可以口服颠茄片等；如果消化不好，可以口服酵母片等进行治疗，也可以口服一些中药进行调理。