灰指甲在医学上称为甲癣、甲真菌病，是由于皮肤癣菌等真菌感染所造成，因此灰指甲的治疗是以抗真菌治疗为主。如果只是远端指甲受累或者受累的比较浅表，可以采取外用的抗真菌的药物，比如阿莫罗芬这一类的甲涂剂。如果全甲受累并伴随指甲的增厚、变碎可以采用口服的抗真菌的药物，比如特比萘芬、伊曲康唑等。需要注意的是，灰指甲的治疗需要一个长期的治疗，一般在3-4个月以上，直到病甲完全脱落才能停止治疗，避免残余的病甲使灰指甲再次复发。