怀孕50天有咖啡色分泌物则不正常，需尽快到医院检查，有可能是先兆流产、胚胎停止发育，有宫颈息肉也会表现出咖啡色分泌物。到医院做B超检查，如果看到宫腔里有孕囊且有胎心胎芽，表现出咖啡色分泌物，有可能是先兆流产造成需要保胎治疗。同时要检查宫颈，如果宫颈没有息肉，出血由宫腔里流出则也需要进行保胎。月经停止50天应看到胎心和胎芽，如果这时没有胎心胎芽，则是胚胎停止发育，需要尽快做人工流产手术。