男性阴茎根部细可能是先天性发育畸形造成，这是很难改变的情况，也是很难进行治疗的。建议病人可以根据具体的情况来分析，如果不影响病人的正常性生活，可以不予以处理。如果影响到病人的正常性生活，建议一定要及时的到医院进行检查，然后对症治疗。还可能是阴茎根部海绵体细胞损伤、外伤或者是不良的手淫习惯造成的，也可以造成根部变细。建议及时的戒除不良的手淫，对局部进行轻柔的按摩和热敷，以促进局部的血液循环，帮助阴茎海绵体细胞恢复，则可以有效的改善这种阴茎根部变细的情况。