肛门上长了个小肉芽，主要包括几个方面的原因：1、皮肤的赘生物比如肛门息肉，一般没有任何的临床症状，一般不需要进行处理的。只有生长速度过快的时候，可以到医院的皮肤科进行局部的激光治疗，治疗以后一般不会复发，局部创口恢复很快。2、属于性传播疾病的范畴，例如病人在既往当中有不洁性行为病史，在感染病毒以后往往会在直肠黏膜和皮肤交界的部位，表现出类似的情况。最典型的疾病就属于尖锐湿疣，如果病人有不洁性行为表现出类似的情况，需要立即到医院的皮肤科确定。局部需要进行激光治疗，全身需要配合免疫治疗并且防止性行为。3、属于比较早期的痔疮，尤其是血栓性的外痔是最多见的一种情况。可以外涂痔疮膏进行处理，效果比较理想。