造成咽部肿瘤的原因一般包括物理诱变因素、化学物质和辐射等。物理诱变因素多见于长时间机械性损伤，比如经常卡鱼刺、骨头等，均可造成咽部肿瘤。不良的口腔卫生习惯，如龋齿、不合适的牙托、残缺的牙嵴等也可能造成咽部肿瘤。化学物质比如烟草中的尼古丁、酒精等，可作为致癌物的溶剂，促使致癌物进入舌黏膜，造成咽部肿瘤。辐射能够造成生物体发生基因突变，造成咽部肿瘤，多见的诱变射线包括电离射线和非电离射线。同时，用于放射线治疗颈部肿物时，也可造成咽部肿瘤。