造成男性肾结石的原因有很多，一般研究认为肾结石是多种因素共同作用的结果，和病人的年龄、职业、饮食的成分和结构、每天水分的摄入量以及代谢和遗传因素都有关系，比如有些男性病人中饮食动物蛋白过多，纤维素过少，有可能会促进尿路结石的形成。饮水少也会使尿中结晶容易堆积，形成结石。高温环境以及活动减少也形成了结石的因素。有一少部分人是由于先天性的解剖结构异常以及感染等疾病所造成，比如先天性甲状旁腺功能亢进、先天性输尿管发育异常、尿路感染等等。