怀孕六周有褐色的分泌物这种情况有两个可能性：1、发生了先兆流产，先兆流产在妊娠早期的女性较为多见，往往表现为下腹部的隐痛伴随阴道的少量出血，大部分的先兆流产经过一段时间的休息和保胎治疗，往往会自行的缓解，母儿的预后是良好的。也有一部分的先兆流产会转变为胚胎停育以及自然流产，因此对于妊娠早期的先兆流产的患者，可以给予黄体酮进行1-2周的保胎治疗。进行超声的随访观察一下胚胎发育的情况，及时发现胚胎停育。2、宫外孕，在妊娠早期如果表现出有阴道出血的现象，一定要排除宫外孕，因为宫外孕会造成女性表现出输卵管破裂大出血，甚至造成失血性休克，因此一旦表现出妊娠早期的腹痛和阴道出血，要尽快做超声检查，确定是否宫内妊娠。如果宫内没有看到妊娠囊，宫外孕的可能性比较大，一定要进行密切的随访，必要的时候收住院进行随访观察。