斑秃的病因尚不完全清楚，一般认为斑秃是一种在遗传背景下，由多种环境激发因素造成的自身免疫性疾病。在遗传易感个体，诱发因素可造成主要由CD8驱使的，TH1型T细胞自身免疫反应，该免疫反应攻击毛囊，造成临床上表现出急性脱发。其主要发生机制可能是毛囊局部免疫赦免被破坏，淋巴细胞浸润，表现出针对毛囊毛球的自身免疫反应，使毛囊及毛干细胞受到免疫攻击而毁损。此外，很多环境因素也和斑秃的发生有关，比如情绪应激，病毒、细菌或其他病原体的感染等，很多人还具有季节性。