阴茎脱皮可以是因为不同的疾病所导致的，因此相对治疗方式也是不相同。若是因为包皮龟头炎等感染所导致的阴茎脱皮，需要进行抗感染治疗。局部可应用抗生素软膏，如红霉素软膏对症治疗，并保持个人的卫生。部分病人清洗包皮或阴茎时，所用的清洗液有一定的腐蚀性，可以对皮肤导致损伤，久而久之就可以导致阴茎脱皮。此种情况一般不需要特殊治疗，病人可随时间延长而自愈。部分病人可因一些过敏原的表现出，导致阴茎局部表现出过敏性皮炎，因此表现出阴茎脱皮，可以应用抗过敏药物对症治疗。