感染性心内膜炎的治疗原则主要是指抗微生物药物治疗的治疗原则。它包括以下一些内容：第一，早期使用，在连续送3~5次血培养之后就可以开始治疗。第二，足量用药，成功的治疗有赖于杀菌，大剂量和长疗程可以完全消灭藏于赘生物类的致病菌，抗生素的联合使用能够起到快速的杀菌作用。第三，静脉用药为主，保持高而稳定的血药浓度。第四，病原微生物不明时，急性者可以选用针对金黄色葡萄球菌、链球菌和革兰氏阴性杆菌都有效的广谱抗生素，亚急性者可以选用针对大部分链球菌的抗生素。第五，已经分离出病原微生物时，应当根据药敏结果来选择抗生素。