甲状腺功能亢进症比较常用的两种药物是甲巯咪唑以及丙硫氧嘧啶，它是有一定的副作用的，比较多见的副作用是表现出皮肤过敏，例如起药疹等，比较严重的副作用是白细胞数目减少，例如中性粒细胞减少，或者是其他粒细胞减少，一旦发生粒细胞减少到一定程度，需要及时停药的。在服用药物的过程中，也可能会表现出肝肾功能损害，因此在服用药物治疗甲亢时，应当定期监测血常规、肝肾功能，一旦发现表现出这些药物副作用，就需要看医生的治疗上调整抗甲状腺药物的剂量，甚至是停止用药。