阴茎上有水泡，最担心的就是生殖器疱疹。生殖器疱疹，是一种经过性接触造成的性传播疾病，常常在生殖器处表现出成簇的小水疱。一般2到3天后，小水泡就可能表现出破裂，破裂后合并细菌感染，就可能表现出疼痛，瘙痒等。如果阴茎上表现出小水泡，应当及时的去医院就诊，可以就诊皮肤科、泌尿外科。如果有不洁性交，要高度怀疑就是疱疹病毒感染。应当进行必要的检查，确诊清楚后，再进行有效的治疗。也可能是和不注意卫生，造成感染，表现出小水泡。