肛瘘一般属于化脓性感染，致病菌多为大肠埃希菌或者是金黄色葡萄球菌，还有一些结核性的肛瘘。如果表现出肛瘘，应该积极的给予抗生素抗感染治疗，还应该积极的应用药物冲洗瘘管，保持瘘管通畅，可以减轻病人的症状。完善术前检查，经过手术，将内口也就是感染源彻底的切除，达到根治的效果。如果肛瘘瘘管位置比较低，可以行肛瘘切除术，适用于低位肛瘘的治疗。如果瘘管位置比较高，可以行高位肛瘘切开挂线治疗，利用橡皮筋机械性压迫作用，缓慢切开肛瘘，术后保持局部清洁，经常用温盐水或中药坐浴或者熏洗。