由于卵巢囊肿的大小、性质以及具体症状不同，所以治疗的方法就会有很大差异，如果女性检查彩超，是提示双侧卵巢呈多囊样改变，这时并不是有真正的卵巢囊肿，而是由于卵子没有发育成熟形成的小卵泡，一般都要考虑是多囊卵巢综合症造成，多需要服用达英三五来进行调理治疗。如果检查后考虑是普通的卵巢囊肿，而且小于三厘米以下，可以考虑口服桂枝茯苓丸，或者是金刚藤胶囊进行治疗，也可以不用特殊处理治疗，但对于大于五厘米的卵巢巧克力囊肿，常常就需要考虑行腹腔镜手术切除治疗。