排尿后阴茎痛最多见的原因就是尿路感染，其他还有尿路结石、前列腺炎、淋病等都可能造成排尿后阴茎的疼痛。尿路感染最典型的临床症状就是尿频、尿急、尿痛等，而尿路结石可以损伤尿路的粘膜造成出血、感染，因此也会造成排尿是阴茎疼痛。前列腺疾病一般都会伴随一些排尿困难、夜尿次数增多，有时也会造成排尿时疼痛感。淋病时会有大量的脓性分泌物，并伴随排尿时刺激感。有些病人是因为包皮过长而引发的包皮垢、龟头炎，也可造成排尿后的疼痛感。因此，这种情况可以进一步化验尿液常规检查明确诊断，如果感染比较严重，必要时可经过抗炎治疗才可治愈。