甲硝唑是属于抗生素类的药物，甲硝唑栓塞肛门的作用主要是抗细菌感染，主要针对肛门、直肠、女性生殖系统的厌氧菌感染有治疗作用。甲硝唑主要针对厌氧菌以及原虫等有治疗作用，比如消化链球菌、滴虫感染、阿米巴感染等有特效，由于口服甲硝唑药物对消化道刺激性比较强，可表现出恶心、呕吐的症状，经过肛门给药减轻消化道刺激症状，甲硝唑对于破伤风有一定治疗作用。肛门给药可以快速针对肛门、直肠以及会阴区域感染起到治疗作用，副作用也小，注意孕妇以及哺乳期妇女是禁用甲硝唑的，使用药物前需要咨询医生。