肛门疼痛多见于痔疮发病，内痔发病表面粘膜溃疡形成，受到肠液的刺激而造成疼痛；血栓性外痔形成造成的疼痛一般是闷痛或针刺样疼痛。肛裂也可以造成肛门疼痛，因为大便干燥，排便困难，在排便中肛门有撕裂性疼痛，便后疼痛不减是肛裂疼痛的特点。痔疮和肛裂造成的疼痛，一般都会有便血症状。肛门周围炎也可以造成肛门疼痛，肛门周围炎疼痛，多见于腹泻或者便秘后，造成肛隐窝感染。直肠损伤造成的肛门疼痛，见于进食不容易消化的食物在排出时损伤直肠粘膜造成的疼痛，比如比较多见的大枣核划伤直肠粘膜。