胃食管反流病病人采取手术治疗，并不能百分之百根治。手术治疗一般首选方法是胃底折叠术。手术的成功率大约85%-90%，死亡率大约占到0*2%，手术之后再发病率大约占到2%-8%。手术后可能会并发咽下困难和气胀综合征。手术不能使症状根本治愈，大约一半以上的病人仍然需要再次接受药物治疗，也不能避免以后发生食管癌。手术的适应症主要包括年纪较轻，手术条件好的病人，可以作为药物维持治疗的另一个选择，控制反流及其伴有的吸入性肺炎也可以采取手术治疗的方法。