霉菌性肠炎的患者可以通过一般治疗、药物治疗、手术治疗等方法，具体如下：

1、一般治疗

患者平时要注意饮食，忌食辛辣、生冷、油腻等食物，以免加重肠胃负担。同时注意适当地进行运动锻炼，提高自身免疫力，有助于疾病恢复。

2、药物治疗

霉菌性肠炎的患者可以采取制霉菌素片、氟康唑胶囊、伊曲康唑胶囊等药物进行抗真菌治疗，改善腹泻、腹痛等不适感。

3、手术治疗

患者病情严重时可以使用手术切除病变肠段，术后避免食用变质食物，加强手部卫生。