幽门螺旋杆菌治不好有如下几种原因：1、可能是药物耐药造成，幽门螺旋杆菌治疗主要是三联疗法或者是四联疗法，其中含有两种抗生素，比如阿莫西林、克拉霉素、甲硝唑等。如果有抗生素耐药的情况，可能会造成幽门螺旋杆菌治不好，这时就需要调整抗生素，重新杀菌治疗。2、可能是用药不规范造成。杀幽门螺旋杆菌疗程一般是2周左右，而且要几种药同时服用，如果中间有随意停药或者是剂量不正确，容易造成杀菌不成功。3、可能是清除幽门螺旋杆菌之后，再次被其他人传染上。这要检查周围一起生活的人，如果有幽门螺旋杆菌感染，需要一同杀菌治疗。