肛瘘是一种多见的肛门直肠疾病，复发率比较高，西医一般认为，肛瘘是肛门直肠周围脓肿的后遗疾患。肛门脓肿成脓以后，经过肛门周围的皮肤或者肛管直肠黏膜破溃，脓腔随之逐渐缩小，脓腔壁结缔组织增生，脓腔缩窄，形成或弯或直的管道即为肛瘘。多见的原因有手术、外伤、灌肠、注射等损伤肛管，直肠细菌入侵伤口造成感染，此类肛瘘内口既是损伤处，和肛窦无关。还有一些特殊的感染，比如结核、放线菌感染，也会造成肛门直肠感染，因此形成肛瘘。