变形杆菌食物中毒的病人，经过积极有效的抗生素治疗，以及补液和抗过敏治疗等等以后，预后绝大部分比较良好，没有严重并发症的病人，大部分可以恢复健康。但是，既往身体有基础疾病的病人，可以诱发休克，以及弥漫性血管内凝血，以及呼吸衰竭，循环衰竭而造成危及生命。变形杆菌食物中毒的治疗，主要是以对症治疗为主，胃肠型的以纠正电解质失衡解痉和抗感染治疗为主，抗感染的药物可选择喹诺酮类抗生素，过敏性的以抗过敏治疗为主。