临床上把女性在月经前后及月经期发生的头痛称为经期头痛。这可能和血清中的雌激素浓度变化有关。在月经前后，血清中的雌二醇浓度降低，造成颅内外血管及子宫血管对某些因素如5-羟色胺等物质更敏感，因此造成血管张力的变化，使一部分对此敏感的病人发生头痛。月经后，血清中雌二醇浓度回复至正常，病人的头痛亦可缓解。 还有一种可能性存在，雌激素（包括雌二醇）可经过刺激泌乳素分泌，进而直接或间接地刺激前列腺素分泌，而前列腺素作用于血管，造成血管的收缩和扩张，这种变化由于雌激素的影响也呈现周期的变化，因此激发头痛发作。