肠镜和肛门镜是有一定的区别的，肠镜检查可以对全部的结肠进行检查，甚至可以对小部分的回肠进行检查，然而肛门镜仅仅是对病人的直肠部位进行检查。肠镜和肛门镜的肠道准备也不一样，肠镜的准备要求比较充分，也比较严格，需要病人多喝水，以及吃一些泻药以清洁肠道，但是肛门镜仅仅需要灌肠，把直肠内的粪便灌出来了就可以了。因此肠镜和肛门镜还是有很大的区别的。