小孩阴茎肿疼的原因，首先考虑可能是因为龟头炎或者是因为包皮过长，此外也不排除是因为急性的尿道炎所造成的。这个时候一定要造成注意，及时的带孩子去医院做一个详细的检查，然后再进行合理的治疗，平时还要注意孩子的外阴清洁，可以使用一些高锰酸钾水帮孩子进行清洗，这样也能够起到很好的杀菌消毒的作用，此外平时饮食上面一定要注意，防止让孩子吃一些过于刺激性的食物，这样也可能会造成后期的恢复。