卵巢囊肿5公分，要区分是生理性的卵巢囊肿，还是由于肿瘤造成的卵巢囊肿。若是生理性的卵巢囊肿，一般月经干净后，会自行消失，不需要处理和治疗。如果定期检查，卵巢囊肿持续存在、或者缓慢增大，多为良性卵巢囊肿，可以考虑手术治疗。而对于5公分的恶性，极少数患者为恶性卵巢囊肿，需要手术治疗。