益生菌可以起到调理胃肠功能紊乱的作用，具体应用多久还是要根据具体应用的效果，和根据病人的具体病情的严重情况来进行明确。如果病人病情比较轻微，用药效果比较好，可能应用半个月，或者是一个月左右就会完全恢复，就可以停用药物。但是如果病人病情比较严重，应用此药物效果并不是特别明显，用药的时间可能就会更久一些，也可以搭配着一些其他的药物共同治疗。