指甲凹凸不平可能是营养不良引起，大多由于缺锌、缺钙、蛋白质缺乏等因素所致。其次，还可能是长时间用手直接接触化学制剂所致，化学制剂会对指甲造成一定的损伤，出现凹凸不平的现象。指甲凹凸不平也可能是真菌感染引起，真菌感染会直接侵犯甲床导致甲病变，常见于灰指甲疾病，患者也可能会出现甲板浑浊、变色等症状，指甲凹凸不平时应入院进行微量元素检查以及皮肤视诊来诊断。