胃食管反流性咳嗽，病人的支气管粘膜存在炎症改变，可能和胃食管反流造成的轴突反射，释放P物质等神经源性的炎性介质有关，而少部分反流甚至到达咽喉部，被误吸入气管直接刺激气管粘膜而造成咳嗽，这在研究中已得到证实。胃食管反流性咳嗽的发生机制和食管下段括约肌的一过性松弛，胃内容物反流，或微量的胃内容物误吸入气管有关，其主要是因为胃反流的酸性胃内容物刺激食管下段的粘膜感受器，经过迷走神经传导的食管，支气管反射而造成咳嗽。食管下段括约肌运动功能失调，是产生反流的重要原因。造成食管下段内的压力降低，关闭不全，使胃内容物容易反流，同时不能经过蠕动及时清除反流的刺激物。胃食管反流性咳嗽是慢性咳嗽多见的病因之一，占慢性咳嗽的10%到20%。