造成肛门里面一阵一阵的疼痛的原因是比较多的，大部分是肛肠疾病造成的。首先，肛裂是肛管裂开后合并感染形成的一种慢性溃疡。由于慢性炎症和粪便的不良刺激，会造成肛门括约肌痉挛，因此造成肛门里面阵痛。其次，痔疮是痔静脉曲张形成的，外痔和混合痔都会造成肛门里面阵痛。最后，肛窦炎和直肠炎属于一种感染性疾病，会造成局部充血、水肿，因此表现出肛门里面的阵痛。直肠肿瘤也是造成肛门里面疼痛的主要原因之一，正常情况下良性肿瘤造成的疼痛比较轻，恶性肿瘤造成的疼痛比较明显。由于造成肛门里面阵痛的原因很多，临床上的治疗方法也是不一样的，病人应当到正规的公立医院进行检查治疗。