变形杆菌食物中毒的实验室检查，可以取可疑的食物，呕吐物或者粪便作细菌的培养，分离出有同型的变形杆菌。分离出的变形杆菌必须作血凝试验，才能确认普通变形杆菌对ox19，奇异变形杆菌对oxk的凝集效价应在4倍以上增长者，才能够肯定诊断。如果做间接的血凝试验，灵敏度可提高两倍到16倍，同时病人可以完善血常规检查，若是在胃肠炎型病人，白细胞总数以及中性粒细胞可以增高，过敏型的病人嗜酸性粒细胞可以增高。