做妇科检查时，总体而言，做阴超比做普通的B超更好，因为阴超是把超声探头直接放入阴道内，其频率更高，可以分辨更加细微的结构。而腹部超声的检查要受到腹腔内气体的干扰，而且对于腹型肥胖的病人及腹部脂肪较厚，会影响检查的结果。而阴道超声的检查不受气体的干扰，对子宫卵巢的疾病检查诊断更加准确，如子宫内膜息肉，子宫小肌瘤，卵巢的小病灶等都可以比较清楚地观察到。但是阴道超声由于探头频率高，观测的深度不够，有时也需要结合腹部超声来进行综合判定，这样子对诊断会更加有帮助。同时，阴道B超对于月经期的女性是不能使用的。