真菌性角膜炎发病较隐秘，潜伏期较长，有的可能和外伤等因素有关。其早期症状可能不明显，只有轻度的异物感、不适或流眼泪等表现。多数病人就诊时，其真菌性角膜炎已发展得较为严重，此时需使用抗真菌药物和辅助药物治疗。若无法消除真菌或真菌感染持续向眼内发展，则需进一步检查或手术治疗。