针对儿童遗粪症患儿的病情，进行辨证施治。对于便秘伴随遗粪症的，治疗原则是通因通用，选用大承气汤加减治疗。有人认为功能性遗粪症主要是因为肝郁脾虚，输运失职所造成的，选用疏肝健脾收涩止泻之法，对腹泻药方加减治疗，能够取得一个比较好的疗效。也可以选用足三里、大椎等穴位进行针灸、砭针、埋线治疗的疗效。小儿遗粪症的病因比较复杂，是一种慢性的行为障碍，综合治疗能够提高遗粪症的症状的缓解率，改善患儿的心理状态，所以中医强调综合治疗和长时间治疗的方法，非常重要。