肛门上长肉芽是因为肛门部长有肛门息肉、性疾病的传播症状、早期的痔疮等。肛门长息肉也会形成小肉芽，大多数的肛管息肉是慢性炎症反复刺激或排便时刺激造成的炎性息肉，不会造成临床症状，不需要处理。如果生长速度过快，可以到医院进行激光治疗，如果有不洁性行为的病史，在遭到病毒感染后会在直肠黏膜和皮肤交界的部位表现出类似情况。最典型的疾病就属于尖锐湿疣，应当尽快去医院就诊，局部可以采取激光治疗，全身治疗应当防止性行为，早期痔疮也会表现出肛门上长肉芽，可以进行涂抹痔疮膏治疗。