如果胃肠道感染了细菌，我们有条件可以进行大便化验，进行菌培养，根据细菌培养对哪一种抗生素敏感，针对性使用抗生素，则第一抗菌效果好，第二对身体的损害也比较小。但是一般的细菌性感染症状不严重，或者细菌培养没出来结果的时候，医生都会根据经验性选药。一般肠道感染多半都是革兰氏阴性杆菌，常会选用的抗生素是喹诺酮类或者是三代的头孢抗生素。若是不满18岁的小朋友不能使用喹诺酮类的抗生素，可以选用三代头孢抗生素，或者是黄连素进行抗细菌的治疗。如果出来细菌培养，比如说是对艰难梭状芽胞杆菌感染，也可以同时加用益生菌进行治疗，而霉菌的感染也要针对抗霉菌的治疗。因此就肠道的细菌感染，一方面我们可以经验性的用药；另一方面，如果严重的也可以进行变培养和药敏试验进行对症治疗。