肛门检查的方法有很多，其中在临床上比较常用的简易方法就是肛门的指检。具体的方法就是医生用一个手指头伸进病人的肛门，经过触诊来判断肛门的疾病，准确的直肠指检，大致可以确定距肛缘7～10cm的肛门、直肠有无病变和病变的性质。除了肛门指检之外，还有肛门镜检查，肠镜检查等比较直观的检查方法，经过这些方法还可以提取活检，进一步明确病变部位的病理性质。在检查的时候病人可以采取多种体位，比如膝胸位，截石位，侧卧位等等。