全国外贸单证员证书颁发机构主要分布在中国各地的人力资源和社会保障部门，这些部门负责管理和监督外贸单证员的培训、考试和证书颁发工作，以确保外贸单证员具备一定的专业知识和技能，为我国对外贸易提供高效、规范的服务。

外贸单证员证书的颁发主要由以下几个部门负责：

1、人力资源和社会保障部：作为国家人力资源和社会保障部门，人力资源和社会保障部负责制定外贸单证员职业标准、培训大纲和考试大纲，组织实施外贸单证员的培训和考试工作，人力资源和社会保障部还负责对外贸单证员证书进行统一管理和监督。

2、商务部：商务部是我国对外贸易的主要管理部门，负责制定和实施对外贸易政策、法规和标准，商务部通过与人力资源和社会保障部等相关部门的合作，共同推动外贸单证员职业的发展和培训工作。

3、各省、自治区、直辖市人力资源和社会保障厅(局):在地方层面，各省、自治区、直辖市人力资源和社会保障厅(局)负责本地区的外贸单证员培训、考试和证书颁发工作，这些部门会与当地商务部门密切合作，确保外贸单证员培训工作的顺利进行。

4、各外贸企业和行业协会：外贸企业是外贸单证员的主要服务对象，各外贸企业和行业协会在外贸单证员培训和证书颁发方面发挥着重要作用，他们会组织或参与外贸单证员的培训活动，协助人力资源和社会保障部门进行考试工作，并向获得外贸单证员证书的人员提供就业服务。

全国外贸单证员证书颁发机构主要分布在中国各地的人力资源和社会保障部门，这些部门与商务部门、外贸企业和行业协会等多方共同推动外贸单证员职业的发展，为我国对外贸易提供专业、高效的人才支持。