健康管理师证书是由多个部门共同颁发的，主要包括以下几个部门：

1、国家卫生健康委员会(National Health Commission of the People's Republic of China,简称NHC):作为中国政府的最高卫生管理机构，NHC负责制定和发布健康行业的政策法规，对健康管理师的培训、考试和认证工作进行统一管理和监督，NHC颁发的健康管理师证书具有很高的权威性和认可度，是健康管理师职业发展的重要依据。

2、中国职业技能鉴定指导中心(China Vocational Skills Testing and Areditation Center,简称CVTC):CVTC是中国职业技能鉴定工作的主管部门，负责组织和管理全国性的职业技能鉴定工作，CVTC颁发的健康管理师证书是经过严格考核和评估的，具有一定的权威性。

3、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会：各级卫生健康委员会在NHC的指导下，负责本地区的健康管理工作，对健康管理师的培训、考试和认证工作进行具体实施，各级卫生健康委员会颁发的健康管理师证书在各自行政区域内具有法律效力。

4、行业协会和专业机构：为了规范健康管理师行业的发展，提高健康管理师的专业素质，一些行业协会和专业机构也会对健康管理师进行认证，这些认证通常需要经过严格的审核和考核，发放的证书具有一定的权威性和认可度。

5、企事业单位和培训机构：为了满足市场对健康管理师的需求，一些企事业单位和培训机构也会开展健康管理师的培训和认证工作，这些单位和机构颁发的健康管理师证书在一定程度上可以证明学员具备一定的专业知识和技能，但其权威性和认可度相对较低。

健康管理师证书的颁发涉及多个部门，包括国家卫生健康委员会、中国职业技能鉴定指导中心、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会、行业协会和专业机构以及企事业单位和培训机构等，这些部门共同推动了健康管理师职业的发展，提高了健康管理师的专业素质，为广大人民群众提供了更加优质的健康服务。